診療・療養上で必要な指示であれば、どのような指示であっても評価の対象です。
ただし、留意点に記載されている通り、「指示が適切に行われた状態で評価すること」を前提としています。

例えば、寝たきりの患者等でいかなる指示も通じないことが明らかな患者に対して指示を出しても、当該指示は「適切に行われた」とはいえませんので評価の対象ではありません。

吸引時にどのような指示を出されたのかわかりませんが、当該患者の状態に応じて適切な状態で指示を出していたにも関わらず、当該指示に反する行動があったのであれば、「いいえ」と評価できます。